История сохранила ещё одну трагическую дату: в 1930 году власти прекратили деятельность храма и переоборудовали его в клуб. В 1943 году здание сгорело. Впоследствии на фундаменте храма тонкинцы построили деревянный Дом культуры, который был снесён в 90-х годах прошлого века. Но годы шли, сменяя друг друга, и наступили иные времена. 25 января 1998 года состоялся сход православных жителей Тонкино. На сходе прозвучала обеспокоенность верующих, что наш район единственный, где нет православного храма. На собрании верующих был избран приходской совет, старостой которого избрали А.В. Левашова, сына последнего тонкинского священника, протоиерея В.В. Левашова.
Митрополит Нижегородский и Арзамасский Николай (Кутепов) преподал свое благословение на открытие храма в Тонкино 18 февраля 1998 года. Через год была совершена первая после 70-летнего перерыва литургия на тонкинской земле. Службу совершили протоиерей Валерий Юшков (благочинный Уренского округа) и иерей Олег Долгополов (с. Щенники Шарангского района). 18 июля 2000 года на встрече с главой администрации Тонкинского района В.Г. Логиновым было принято решение о незамедлительной закладке фундамента. Долго решался вопрос о месте строительства храма. С большими трудностями пришлось столкнуться приходскому совету, чтобы добиться разрешения на строительство в историческом месте. Летом 2001 года благочинный Уренского округа протоиерей Валерий Юшков в присутствии главы местного самоуправления Т.Ф. Кузнецовой при стечении большого числа прихожан Тонкино провёл освящение земельного участка для Крестовоздвиженского храма. Все работы по продвижению строительства, сбору средств и привлечению внимания предпринимателей и неравнодушных людей проводили приходской совет и лично помощница настоятеля Наталья Павловна Маричева. Основные строительные работы осуществлялись в 2003–2006 годы. 30 мая 2005 года состоялось водружение креста на купол храма.